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ラインナップ

TCR/BCR レパトア解析

特異的抗原認識に関わる免疫細胞の多様性解析を遺伝子レベルで実施します。非バイアス増幅、次世代シーケンス、専用のバイオインフォマティクスなど、最適化された手法を用いることで、高品質なレパトア解析を実現しています。

ネオエピトープ解析

RNA seqとExose seqを併用し、個人ごとに異なるがんに特異的な遺伝子の変異を探索します。分子間結合力も考慮し、抗原提示可能な変異ペプチド(ネオエピトープ)を探索します。シーケンスデータを用いたindel、long indel、splicing variantにも対応可能です。

16S rRNA菌叢解析

それぞれの細菌種で保存された16S rRNA遺伝子のV1V2またはV3V4領域を次世代シーケンスで測定することで、検体に含まれる細菌種の分布(菌叢)を解析します。生物由来(糞便、唾液など)検体だけでなく、環境由来(土壌、食品など)検体にも対応可能です。

成果発表

2021/01/15
論文

Journal of Clinical Medicine

臨床免疫
Effects of Transanal Irrigation on Gut Microbiota in Pediatric Patients with Spina Bifida
J. Clin. Med. 2021, 10(2), 224;https://doi.org/10.3390/jcm10020224
東京慈恵会医科大学 泌尿器科
古田昭 先生
経肛門的洗腸療法(Transanal Irrigation:TAI)を行った二分脊椎患者の便を用いて細菌叢解析を行い、TAI療法による腸内細菌叢への影響を検討しています。当社が実施したコントロール群と治療群の治療前後での16SrRNA菌叢解析結果が重要な解析指標として利用されており、治療前後において特定の細菌種の存在頻度の変化がコントロール群と比較して認められ、TAIによる腸内細菌叢への影響を示唆されております。

2021/01/13
論文

Annals of Clinical and Translational Neurology

臨床免疫
A new clustering method identifies multiple sclerosis-specific T-cell receptors
Ann Clin Transl Neurol. 2021 Jan 5. doi: 10.1002/acn3.51264.
九州大学大学院 医学研究院 神経内科
林史恵 先生
多発性硬化症(MS)患者の末梢血を用いて行った当社TCRレパトア解析のデータをソースにMS患者群とコントロール群の比較を行い、患者群において多様性が高いことが示されております。また、クラスタリング解析も合わせて行われ、TBV4-3のクラスターはHLA‐DRB1*04:05の患者で多く共有されていることが示されております。また、そのクラスター群がCMV抗原を認識することも予測されております。

2021/01/08
論文

Pediatric Surgery International

What is the optimal lipid emulsion for preventing intestinal failure-associated liver disease following parenteral feeding in a rat model of short-bowel syndrome?
https://doi.org/10.1007/s00383-020-04802-0
鹿児島市立病院小児外科
町頭成郎 先生
短腸症候群モデルラットを用いた腸管不全合併肝障害に最適な脂肪乳剤投与の検討を行う研究において、肝内の関連遺伝子発現量を測定する中で当社の遺伝子発現量解析技術が用いられました。

TCR/BCRレパトア解析ガイドブック

必見!これからレパトア解析を実施される先生方へ

レパトア解析には興味はあるけれど、どんな点に注意すればよいのか、何が具体的にできるのか、どのような準備が必要なのかなど、初心者の疑問を分かりやすく解説したレパトア解析ガイドブックを用意しました。
ご希望の方は、下記よりお申し込みください。

ガイドブック 申込み

ガイドブック 申込み

※株式会社パイプドビッツが運営するWebサイトが、別ウィンドウで開きます。

TCR/TCR/BCRレパトア解析ガイドブック

目次ページ数:56、形式:PDF/書籍

はじめに

第1章
TCR/BCRレパトア

  • 多様性獲得のメカニズム
  • 多様性の規模と組み合わせ
  • 遺伝子再構成後のgDNAとmRNAの違い

第2章
レパトア解析法

  • 概要
  • レパトア解析の変遷と弊社の歴史
  • 遺伝子増幅法について
  • メリットとデメリット
  • PCRバイアスによるリスク
  • Multiplex PCRにおける
    プライマーミスマッチのリスク
  • アイソタイプの判定がMultiplex PCRでは不可能である
  • シングルセル解析の位置づけ

第3章
検体採取方法

  • 検体種類別の処理、発送方法
  • 当社へ検体を発送する際の一例
  • 血液(全血)の場合
  • 血液(PBMC)の場合
  • 培養細胞・ソート細胞の場合
  • 組織の場合
  • Total RNAの場合

第4章
解析データの見方

  • 概要
  • レポートファイルの説明
  • 補足資料の説明

第5章
レパトア解析の論文集とQ&A集

  • 当社のレパトア解析を用いた論文の要約集
  • よくある質問と回答集

利用者の声

A大学教授

個別化医療の実現には、腫瘍抗原を同定し、それをターゲットとした細胞傷害性T細胞療法を行うことになる。レパトア ジェネシス社の保有するネオエピトープ探索・同定ソフト並びにTCRレパトア解析は、ターゲットの同定と、それに対するTCRの同定後の遺伝子治療への応用、樹上細胞ワクチン法による治療を可能とし、最先端医療の幕開けを感じさせる

B大学教授分野血液腫瘍学

TCR/BCRレパトア解析により、臨床現場で多くの問題が解決される。私達の教室では骨髄移植後の成否の評価や予測には欠かせないと考えており継続的にレパトア解析を依頼している。また、臨床上の診断や治療効果判定にもこの解析の有用性は極めて高い。最近、レパトア ジェネシス社が開発されたネオエピトープ解析は、血液分野でも応用性は高く、CMLの治療予測にはすぐにでも応用可能と考えられる。臨床上での理解度が革新的に増加する技術であり、応用範囲は非常に広い。

C大学教授分野血液腫瘍学

私達の教室は、血液学、免疫学を基盤として感染症、アレルギー、自己免疫疾患が研究領域であり、臓器横断的な診断を目標としている。その中でも、レパトア ジェネシス社のTCR/BCRレパトア解析により、免疫系が特異的に関与しているかという判断は非常に重要な位置を占める。また、特発性紫斑病の病因はTCR/BCRレパトア解析により解明されると考えている。

D研究所所長分野ウイルス学

TCR/BCRレパトア解析により、感染免疫という研究分野は飛躍的に進むと考えている。今まで、ウイルス感染動物モデルでの解析からT細胞の関与の重要性を明らかにしてきた。今後は、BCR解析による抗体治療薬への応用を期待しており、レパトア ジェネシス社に継続的に解析依頼を行なっている。

E大学教授分野免疫学

生活習慣病(肥満)と免疫系との関連性の中で動脈硬化症モデルマウスを用いて解析を行っている。動脈硬化部位に浸潤する細胞の正確な性状解析にはTCR/BCRレパトア解析が最も有効なツールであると考えている。 レパトア ジェネシス社の解析結果からNKT細胞の関与が強く示唆された。生活習慣病と免疫系の関与という観点からの研究は一見すると関連性は希薄と思われるが、レパトア ジェネシス社の技術により、今後も多くの疾患と免疫系との関わりが明らかとなり、研究の進展が期待される。

F大学教授分野血液腫瘍学

九州地方に多いATLは発症後の致死率は極めて高い。近年、オプシーボの登場により奏功例も確認されているが、その薬効の本態は不明な点も多い。 レパトア ジェネシス社のTCRレパトア解析から、オプシーボ投与後の末梢中の血液像のパターンとTregとの関与が明確になり、今後の治療に幾つかの福音となる可能性は高い。また、ATLの皮膚転移の最終的な確定にはTCRレパトア解析の結果ということになると思っている。白血病・リンパ腫も多くがTCR/BCRレパトア解析を必要とすることになる。今後も継続的に解析を行っていきたい。

G大学教授(海外)分野免疫学

Now we would have extreme use of Repertoire Genesis? s sequencing technology because sequencing T cells on a massive scale would provide more useful representation of the TCR repertoire and provide a fundamental basis for progressing to more detailed cell culture/in vivo experimentation.

解析依頼のプロセス

  • お客さまにしていただくこと
  • 当社が行うこと