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ラインナップ
TCR/BCR レパトア解析
特異的抗原認識に関わる免疫細胞の多様性解析を遺伝子レベルで実施します。非バイアス増幅、次世代シーケンス、専用のバイオインフォマティクスなど、最適化された手法を用いることで、高品質なレパトア解析を実現しています。
ネオエピトープ解析
RNA seqとExose seqを併用し、個人ごとに異なるがんに特異的な遺伝子の変異を探索します。分子間結合力も考慮し、抗原提示可能な変異ペプチド(ネオエピトープ)を探索します。シーケンスデータを用いたindel、long indel、splicing variantにも対応可能です。
16S rRNA菌叢解析
それぞれの細菌種で保存された16S rRNA遺伝子のV1V2またはV3V4領域を次世代シーケンスで測定することで、検体に含まれる細菌種の分布(菌叢)を解析します。生物由来(糞便、唾液など)検体だけでなく、環境由来(土壌、食品など)検体にも対応可能です。
成果発表
- 2024/02/07
- 論文
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
腫瘍免疫
Combination of oligo-fractionated irradiation with nivolumab can induce immune modulation in gastric cancer
http://dx.doi.org/10.1136/jitc-2023-008385
福島県立医科大学 消化管外科
三村耕作 先生
福島県立医科大学 消化管外科 三村耕作先生から放射線治療と免疫チェックポイント阻害剤の複合療法にTCRレパトア解析を用いた論文発表がされました。
ご発表の中では、放射線治療と免疫療法の併用療法がおこなわれた20例の患者の末梢血を用いて、いくつかの解析手法を用いて横断的に疾患特異性や多様性をモニタリングされており、その解析の中のアプローチの一つとして当社のTCRレパトア解析を用いて、それぞれの治療介入による多様性の変動がモニタリングされております。
- 2023/12/27
- 論文
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Journal of Clinical Biochemistry and Nutrition
Dietary phosphate disturbs of gut microbiome in mice
https://doi.org/10.3164/jcbn.23-9
徳島大学大学院 栄養生命科学教育部
織田奈央子 先生
徳島大学大学院 栄養生命科学教育部に所属されていた織田奈央子先生からマウスの腸内細菌に関する論文発表がされました。
論文では、リン酸塩の過剰摂取が腸内細菌叢に及ぼす影響について検証されており、リン酸塩の過剰摂取は腸内細菌叢を乱し、腸管バリア機能に影響を及ぼしていることを示唆されております。
当社では、論文中のマウスを用いた16SrRNA解析を実施させて頂いております。
- 2023/11/22
- 論文
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INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES
臨床免疫
Pre-existing cross-reactive neutralizing activity against SARS-CoV-2 and seasonal coronaviruses prior to the COVID-19 pandemic (2014-2019) with limited immunity against recent emerging SARS-CoV-2 variants, Vietnam
https://doi.org/10.1016/j.ijid.2023.11.008
東京大学大学院医学系研究科 国際保健学専攻 発達医科学分野
モイ メン リン 先生
東京大学大学院医学系研究科 国際保健学専攻 発達医科学分野 モイメンリン先生のグループからSARS-CoV-2の論文発表がされました。
その中で、当社研究者が共同著者として研究に参画し、B細胞受容体(BCR)レパートリー配列を解析し、BCRレパートリー配列由来のT細胞エピトープを同定することで交差反応性を確認することに寄与しております。
BCRおよび主要組織適合性複合体解析の結果、病原性コロナウイルスおよびコロナウイルスのスパイク蛋白のうち、TCR認識エピトープモチーフ(TREM)がTREMペプチドのトップであったことから、SARS-CoV-2に対する既存の免疫は、感冒コロナウイルスへの曝露によるものであることが示唆されました。
TCR/BCRレパトア解析ガイドブック
必見!これからレパトア解析を実施される先生方へ
レパトア解析には興味はあるけれど、どんな点に注意すればよいのか、何が具体的にできるのか、どのような準備が必要なのかなど、初心者の疑問を分かりやすく解説したレパトア解析ガイドブックを用意しました。
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